在食品质量检验实验中，人们会使用高效液相色谱仪进行各组分的研究和分析，然后将所得结果归纳起来，对食品质量做客观评价和分级。有的食品不符合规定则不能销售出去，有的在原料上就出现问题，厂家需要根据结果更换配料方式和原料，为了使这项工作更方便一些，人们需要对这类实验进行建模，这样在以后的实验中只要根据设计好的试验方法进行就行，就不用再去一一尝试和实验了。在使用高效液相色谱仪进行实验建模的时候需要克服很多困难。
一、选择合适的实验方式
分析仪器种类很多，如何在众多选项中做出准确判断成为人们首先应该解决的问题。使用高效液相液相色谱仪与质谱仪的联用技术成为食品质量检验的重要方法。检测实验中，有多种质谱仪可以选择，其中等离子体电感耦合质谱仪的应用效果不错，一系类方法得到认证，并且为后续的实验中提供模型方案。
二、确定样品的提取方法
在准备好分析仪器后就要对样品进行处理，其中样品提取关系着整个实验的成败。在提取有机物成分的时候，人们会选择正己烷或者其它有机溶剂，它的成本较低，容易回收，可以提高待测组分的回收率和进而提高仪器的灵敏度。处理好的样品再进行色谱分析的时候就能进行准确的定性实验了。
三、实验中流动相的选择
如果是将两类仪器联结起来使用，在选择流动相的时候就不能只考虑色谱仪的性能，还要看这个流动相是否会影响组分的质谱分析，或者在进入质谱仪之前是否容易被去除，即它是否会对样品制品分析带来化学干扰，如果没有那就可以选用。
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